《植物生理学报》 2007, 43(6): 1035-1039

茄子品种遗传多样性的RAPD 检测与聚类分析

王秋锦^1,2，高杰²，孙清鹏¹，杨爱珍¹，赵福宽^1,*

1 北京农学院生物技术系，北京102206；2 新疆农业大学园艺学院，乌鲁木齐830052

通信作者：赵福宽；E-mail: zhaofukuan@sina.com；Tel: 010-80798940

摘　要：

用 RAPD 分子标记的方法对来自不同国家的 34 份茄子品种进行遗传多样性分析，从 120 条 RAPD 引物中筛选出有 效的 22 条引物分别对 34 份茄子品种进行扩增，共检测出232 个等位基因位点，每条引物平均检测出 10.5 个，其中 192 个 为多态位点，多态位点比率为 82.76%。POPGENE 结果分析表明，Nei’s 基因多样性 H 为 0.2756，Shannon 指数为 0.4145， 显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331~0.805，根据Jaccard相似系数和组内连接法建立 的系统聚类图，34 份茄子大致可分为两大类型：圆茄类型和长茄类型，这与经典的形态学分类基本上相符，从而从分子 水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。

关键词：RAPD ；茄子；遗传多样性；聚类分析

收稿：2007-07-23   修定：2007-11-05

资助：北京市自然科学基金资助项目(5982006)。

茄子品种遗传多样性的RAPD 检测与聚类分析

王秋锦^1,2，高杰²，孙清鹏¹，杨爱珍¹，赵福宽^1,*

1 北京农学院生物技术系，北京102206；2 新疆农业大学园艺学院，乌鲁木齐830052

Corresponding author: ; E-mail: zhaofukuan@sina.com; Tel: 010-80798940

Abstract:

用 RAPD 分子标记的方法对来自不同国家的 34 份茄子品种进行遗传多样性分析，从 120 条 RAPD 引物中筛选出有 效的 22 条引物分别对 34 份茄子品种进行扩增，共检测出232 个等位基因位点，每条引物平均检测出 10.5 个，其中 192 个 为多态位点，多态位点比率为 82.76%。POPGENE 结果分析表明，Nei’s 基因多样性 H 为 0.2756，Shannon 指数为 0.4145， 显示出丰富的遗传多样性。计算得出的Jaccard相似系数变化范围为0.331~0.805，根据Jaccard相似系数和组内连接法建立 的系统聚类图，34 份茄子大致可分为两大类型：圆茄类型和长茄类型，这与经典的形态学分类基本上相符，从而从分子 水平上支持了以果形作为茄子品种分类指标的观点。

Key words: RAPD ；茄子；遗传多样性；聚类分析